定制各类格氏试剂

问题:MOPAC简介
类型:推荐
提问:newboy1
等级:▲▲
版块:量子化学、计算化学(deng_jin,)
信誉:50%
回复:6
阅读:1996
时间:2005-02-25 02:37:59  编辑    加入/取消收藏    订制/取消短消息    举报该贴    

MOPAC

主页:http://www.cachesoftware.com/mopac/
http://software.fujitsu.com/jp/mopac2002/ (日文主页)
http://venus.netlaboratory.com/material/messe/mopac2002_v1.5/ (日文主页)
http://venus.netlaboratory.com/material/messe/winmopac/ (WinMOPAC日文主页)

简介:
MOPAC是世界上最广泛使用的半经验量化程序,用于研究气体,溶液和固体的化学特性,包括Gibbs自由能,活化能,反应路径,偶极矩,非线性光学特性以及红外光谱,等。它还可以用做为结构-特性(或活性)定量的基础,预测生物学及其它特性,包括致癌性,蒸汽压,水溶解性,反应率等。MOPAC中获取专利的MOZYME算法可以使那些在超级计算机上需要几天或者几周的计算,在PC机上仅需要几分钟。对于包含上千原子的体系,诸如蛋白质,聚合物,半导体和晶体,它们的电子特性计算仅仅需要几分钟或几小时。
此外,MOPAC还包含用于光谱计算的半经验分子轨道程序MOS-F模块(目前版本是5.0)。MOPAC和MOS-F本身并不包含图形用户界面,但可以和CAChe,LinMOPAC,WinMOPAC,HyperChem或CS Chem3D等图形用户界面的程序结合使用。
MOPAC早先作为免费软件发布,最高版本为MOPAC 7.0。此后成为商业软件。MOPAC目前的版本是MOPAC2002 v1.5(WinMOPAC v3.9)。

功能:
MOPAC
1. 计算方法有:在MOPAC中有:AM1,AM1-d,PM3,MNDO,MNDO-d,MINDO/3;在MOS-F中有:CNDO/2,CNDO/S,CNDO/S2,CNDO/S3,INDO/S。适用原子:
MINDO/3(H,B,C,N,O,F,Si,P,S,Cl);
MNDO (1977)(H,Li,Be,B,C,N,O,F,Na,Mg,Al,Si,P,S,Cl,K,Ca,Zn,Ga,Ge,As,Se,Br,Rb,Sr,Cd,In,Sn,Sb,Te,I,Cs,Ba,Hg,Tl,Pb,Bi,S,Cb);
AM1(H,Li,Be,B,C,N,O,F,Na,Mg,Al,Si,P,S,Cl,K,Ca,V,Fe,Cu,Zn,Ga,Ge,As,Se,Br, Rb,Sr,Mo,Pd,Ag,Cd,In,Sn,Sb,Te,I,Cs,Ba,Pt,Hg,Tl,Pb,Bi,Si,S,Cb);
PM3 (1985)(H,Li,Be,B,C,N,O,F,Na,Mg,Al,Si,P,S,Cl,K,Ca,Ti,Zn,Ga,Ge,As,Se,Br,Rb,Sr,Cd,In,Sn,Sb,Te,I,Cs,Ba,Hg,Tl,Pb,Bi,Cb);
PM5(H,Li,Be,B,C,N,O,F,Na,Mg,Al,Si,P,S,Cl,K,Ca,Zn,Ga,Ge,As,Se,Br,Rb,Sr,Cd,In,Sn,Sb,Te,I,Cs,Ba,Hg,Tl,Pb,Bi);
mndo_d(Na,Mg,Al,Si,P,S,Cl,Zn,Br,Cd,I,Hg)。
2. 可以进行的计算有:几何优化,过渡态结构,激发态结构,线性比例SCF计算(MOZYME方法),反应坐标能量图,热构成(气相或溶液),简正模式振动分析,溶剂特性(气相,水,辛醇,等),IR光谱,原子电荷,极化率,偶极矩,分子轨道,电子密度,梯度范数,力,能量分配,ESP原子电荷,键序,参量化分子静电势,体系间交叉结构,氨基酸片断顺序的结构分析,IRC/DRC。
3. 支持的输入文件格式:MOPAC,MOS-F,Gaussian输入文件(*.gjf),Gaussian fchk文件(*.fch),Cartesian文件(*.car),PDB。
4. XMO工具可以显示分子。
MOS-F
1. 进行半经验分子轨道方法INDO/S,CNDO/S,CNDO/S2,CNDO/S3和CNDO/2等的计算。
2. 单电子激发组态相互作用(CIS)的光谱计算,支持单重激发态和三重激发态。CIS还能计算激发态的电子密度和电偶极矩。
3. 随机相位近似(RPA)的光谱计算。
4. 分子特性计算:含频率极化率,静态第一超极化率,电-光泡克尔效应,产生二次谐波,光学检波,静态第二超极化率,包含克尔效应的直流电场,包含二次谐波的直流电场,产生三次谐波,简并四波混频,包含光学检波的直流电场。
5. 用Onsager模型进行SCRF计算,预测溶液中的分子特性:CIS/RPA波函的电子光谱;用CIS波函预测激发态的电子密度和电偶极矩;用CIS波函计算含频率极化率,第一超极化率,和第二超极化率。
6. 解析的Pariser-Parr,Nishimoto-Mataga,Nishimoto-Mataga-Weiss,Ohno,Ohno-Klopman,和DasGupta-Huzinaga公式,用于求解双中心电子排斥积分。
7. 支持的坐标输入格式有Gaussian型Z矩阵和MOPAC内坐标。
8. 到WinMOPAC的输入/输出接口。
9. 对溶质,自动计算空穴半径;通过指定溶剂名称,自动设置介电常数和折射率。
10. 改善SCF收敛的DIIS方法。
11. 转动常数;惯量主轴和偶极矩的夹角。

MOPAC2002 V1.5和WinMOPAC 3.9的新功能:
1. MINDO,AM1,PM3,PM5新增加对13种过渡金属(Sc,Ti,V,Cr,Fe,Co,Ni,Cu,Zr,Mo,Pd,Ag,Pt)的支持。
2. MOS-F模块升级到6.0。可以用AM1,PM3,PM5计算电子光谱,支持更多的元素;考虑溶剂影响;计算极化率和超极化率;直接SCF方法;快速的直接四指数积分变换方法。
3. 线性标度COSMO方法,能够对大分子进行COSMO计算。

平台:Windows NT4.0/95/98,DOS,Linux/Unix。

资源:

与MOPAC有关的资料

相关软件:

1.JMol

2.Molden

3.CAChe
回复人:lybchgf, (Gaussian IR) 时间:2006-08-21 10:07:56   编辑 1楼
资源不错,加0.3分


回复人:ballkicker, (少俊气如虹) 时间:2006-08-25 15:31:30   编辑 2楼
good


回复人:yjbjqn1106,▲▲ () 时间:2006-09-22 23:08:03   编辑 3楼
资源不错,加0.3分


回复人:liman0108, (一个好学者) 时间:2007-03-18 16:36:29   编辑 4楼
资源不错,加0.3分


回复人:tjjcx, () 时间:2005-11-20 16:17:46   编辑 5楼
资源不错,加0.1分


回复人:季学军, (我是一家公司的技术人员,) 时间:2008-08-06 06:47:44   编辑 6楼
资源不错,加0.3分




问题讨论没有结束...
您尚未进入本论坛,登录之后才可以回贴
用户名:密码:    游客  新用户免费注册
11msec



版权所有 中国化学化工论坛 
可转载本站文章 但请务必注明出处 本站法律顾问 方利律师  
www.ccebbs.com E-Mail:ccebbs00@126.com
Chinese Chemistry and Chemical Engineering BBS