定制各类格氏试剂

问题:哪位能提供一些用gaussian找过渡态的资料?
类型:求助 (悬赏分:3分)
提问:kez
等级:▲▲▲
版块:量子化学、计算化学(deng_jin,)
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回复:11
阅读:2214
时间:2005-03-19 20:22:09  编辑    加入/取消收藏    订制/取消短消息    举报该贴    

最好是g98W版本的
最近发现,可能用过渡态的键长差异,有助于分析不同取代基的离去性质。
谢谢!
回复人:kez,▲▲▲ (我为人人,人人为我) 时间:2005-03-19 20:24:17   编辑 1楼
exploring chemistry with electronic structure里面,讲找过渡态,举例用的unix的input file。不知这个input file可否用于gaussian windows版本?


回复人:kez,▲▲▲ (我为人人,人人为我) 时间:2005-03-19 20:31:28   编辑 2楼
这个东东能否用于g98w里面找过渡态?
#T RHF/6-31G(d) Opt=(QST2,AddRedundant) Test
SiH2+H2 -->SiH4 Reactants

O,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 $ 5 A2 2 180.0
R=2.0
A1=80.0
A2=22.0

SiH2 + H2 --> SiH4 products

0,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5
4 5



回复人:deng_jin,▲▲▲ (理论有机,研究方向:利用计算机辅助量化计算研究外部场(电磁复合场)对空间有机选择性合成) 时间:2005-03-19 21:37:36   编辑 3楼
论坛ftp计算化学资源我得文件夹中量化使用手册里面的高斯类文件夹中看有你需要的东西否?


回复人:大尾巴狼,▲▲ (物理化学) 时间:2005-03-19 22:14:38   编辑 4楼
YES!

------------
这个东东能否用于g98w里面找过渡态?
#T RHF/6-31G(d) Opt=(QST2,AddRedundant) Test
SiH2+H2 -->SiH4 Reactants

O,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 $ 5 A2 2 180.0
R=2.0
A1=80.0
A2=22.0

SiH2 + H2 --> SiH4 products

0,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5
4 5



回复人:hakuna, (弱水三千 一瓢竞渡) 时间:2005-03-20 08:37:51   编辑 5楼
GAUSSIAN输入文件在unix和windows的区别只是存储时换行格式不同,文件内容和格式是一样的。


回复人:kez,▲▲▲ (我为人人,人人为我) 时间:2005-03-20 08:47:56   编辑 6楼
我把上面那段代码存成gjf文件,结果用g98w打开。
结果在title section部分出现下列东西,运行错误
O,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 $ 5 A2 2 180.0
R=2.0
A1=80.0
A2=22.0

是不是我的分行有误?



回复人:kez,▲▲▲ (我为人人,人人为我) 时间:2005-03-20 09:02:56   编辑 7楼
我已修改成下面的,还是不行。原因可能是找过渡态需要有两个molecule specification,而用g98w打开的话,只能识别一个molecule specification
#T RHF/6-31G(d) Opt=(QST2,AddRedundant) Test

SiH2+H2 -->SiH4 Reactants

O,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 $ 5 A2 2 180.0

R=2.0
A1=80.0
A2=22.0

SiH2 + H2 --> SiH4 products

0,1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

4 5



回复人:kez,▲▲▲ (我为人人,人人为我) 时间:2005-03-20 09:20:35   编辑 8楼
奇怪,我直接打开g98下的excercise下的3_07.gjf,也不能运行。
请问如何解决?



回复人:kez,▲▲▲ (我为人人,人人为我) 时间:2005-03-20 14:23:02   编辑 9楼
把AddRedundant改为Redundant之后,可以运行了。奇怪哉


回复人:supi, (厦门大学研究生、厦大理论化学论坛斑竹) 时间:2005-03-22 09:43:47   编辑 10楼
Redundant
是G98的关键词
AddRedundant在G98中已经废弃,但在G94中可以用


回复人:deng_jin,▲▲▲ (理论有机,研究方向:利用计算机辅助量化计算研究外部场(电磁复合场)对空间有机选择性合成) 时间:2005-03-22 19:15:46   编辑 11楼
接受答案了。


得分人:hakuna-2,supi-10,大尾巴狼-3,


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