问题：一个氢原子能形成两个氢键吗?
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提问：zhangjie79
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时间：2007-10-18 22:11:48 编辑加入/取消收藏订制/取消短消息举报该贴

各位兄弟姐妹,最近我测了一个晶体,发现里面CIF文件里竟然显示着一个氢原子能形成了两个氢键:

N2-H2A...O1 0.86 2.39 2.899(2) 118
N2-H2A...N3 0.86 2.43 3.107(3) 137
大家帮我看看这有可能吗?但又是机器测出来的,我又不得不信,因为最近要投稿,就因为这个问题卡在这里了,真是急死我了.谢谢大家帮忙.

回复人：tobby,▲▲▲ (一个热爱化学工作的女生！) 时间：2007-10-19 11:05:29 编辑

1楼

你解晶体结构的时候氢原子是怎么加上去的？是不是强制加上去的，如果是的话一般距离是确定的，还有就是如果数据比较好的话，H原子的峰在精修的时候也可以修出来的。你也可以根据你物质的本身结果和电荷的平衡情况来判断是否有这个氢。如果解晶体结果很牛的人，一般不需要化学知识，但是如果平常还是需要利用常用化学知识来解析的。在解析结构后，软件一般自动认为两者之间的距离小于范德华半径的话就生成氢键的。至少一氢原子有两氢键是很普遍的，应该不能作为写文章的卖点，或者说新的“idea".还有一点我不明白的是，楼主不是做晶体的为什么会测晶体呢？

回复人：wangsui,▲▲▲ (我不思故我不在) 时间：2007-10-18 22:35:43 编辑	2楼
我不是搞晶体的。从普通的化学知识来说，氢原子只能参与形成一个氢键，据说在晶体结构当中是允许这样的。也有可能是因为晶体没有长好，或者衍射点出现了虚像（原子分裂）造成的。

回复人：fl9561,▲ (一个做化学方面工作的人。) 时间：2007-10-18 23:11:43 编辑	3楼
理论上是不能的！晶体是不是有其他杂质？

回复人：xiaoyaolcl,★★★★★ (由于爱好,所以从事) 时间：2007-10-19 07:33:35 编辑	4楼
先高清楚氢键形成的原理,然后就一目了然了呀

回复人：xfg1017,▲▲▲▲ (社会主义好) 时间：2007-10-19 09:06:26 编辑

5楼

你这个结果挺好的哈
N2-H2A...N3 0.86 2.43 3.107(3) 137
0.86是N2-H2A的距离，2.43是H2A...N3 的距离，你可以查一查2.43这个距离小于氢原子和氮原子的范德华半径之和2.75，这说明这两个原子之间是有氢键的。
再就是三中心的氢键（三个非氢原子共享一个氢原子）有时候是存在的。详见《单晶结构分析原理与实践》一书（陈小明和蔡继文合编）117页。

回复人：zhangjie79,▲ (做金属有机方面的研究，做配合物，培养单晶等。) 时间：2007-10-19 10:39:20 编辑

6楼

谢谢楼上的大虾,因为我也不是搞晶体的,所以各种晶体学上的软件也不会用,不然软件里可能可以测一下.听说氢原子都是在精修的时候强制性加上去的,位置都是主观定的,所以我在想是不是精修定位出了问题?另外我想问一下,如果氢原子和一个N,O等原子的距离小于范德华半径是不是非得产生氢键,还有到底有没有两个氢键这种情况.这个情况真的很奇怪,大家帮我看看.

回复人：zhangjie79,▲ (做金属有机方面的研究，做配合物，培养单晶等。) 时间：2007-10-19 16:00:59 编辑

7楼

谢谢楼上的,这个氢是肯定存在的,因为我已经做过核磁共振了,你说的"一氢原子有两氢键是很普遍的"是真的吗?如果真的那样就太好了,因为我一直觉得有问题在里面所以不敢发表论文,这下可好了,我只要如实写上去就好了,请问楼上的能否给我提供一篇相关的文献(一氢原子有两氢键的),真的非常的感谢你的回答. 我的邮箱:chemie@yahoo.cn
至于我为什么测晶体,虽然我是做有机合成的(对晶体不懂),但如果有晶体数据论文可以发的好一点.

回复人：zhangjie79,▲ (做金属有机方面的研究，做配合物，培养单晶等。) 时间：2007-10-19 21:22:02 编辑	8楼
４楼的大虾，我查了《单晶结构分析原理与实践》的确有你所说的三中心的氢键，不知道这种键常不常见

回复人：zhangjie79,▲ (做金属有机方面的研究，做配合物，培养单晶等。) 时间：2007-10-21 20:59:12 编辑	9楼
已经打分了！

得分人：xfg1017:1,tobby:1,

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